1948年1月建院时设置检验科，时由住院医师何锡祜兼负责人。经历75年的发展，目前检验医学科获得“浙江省工人先锋号、省市共建重点医学学科、衢州市医学重点学科、衢州市高技能人才创新工作室、市青年文明号、衢州市抗击新冠肺炎疫情先进集体”等荣誉称号，市临床检验质控中心挂靠单位，设有俞云松教授专家工作站。

检验医学科现有员工69人，拥有高级职称17人，博士2人，硕士17人。开设临床血液、体液检验、临床生化检验、临床免疫检验、临床微生物检验、临床分子遗传学等亚专业学科，集临床检验、教学、健康体检、医疗器械GCP试验、实验室诊断技术研发等服务于一体。开展检验项目500余项，年完成检验样本300余万份。

检验医学科专业基地现有配置有Sysmex全自动血液分析流水线、流式细胞仪、骨髓图像报告系统。急诊生化免疫分析仪、全自动尿液分析流水线、Stago全自动凝血分析流水线、Abbott GLP-1全自动生化免疫流水线、BD自动血培养仪、BD结核杆菌快速液体培养仪、自动细菌鉴定药敏系统、BD MALDI-TOF质谱仪、自动酶免分析仪、数十套荧光PCR仪等高精尖检验专业设备。其中Abbott GLP-1全自动生化免疫流水线为亚太地区规模最大。

2012年取得浙江省检验医师规范化培训专业基地资格，现为国家住院医师规范化培训检验医学科专业基地，是四省边际周边地市唯一检验医学科专业住培基地。专业基地清洁区设有示教室、自学教室、可连接内网与外网的电脑机房，医院数字化图书馆有专业中英文数据检索平台等。2021年开设检验医学专科门诊，为患者提供实验室检测服务、结果解释和咨询服务，参与临床MDT等。

检验科数年来参加卫生部和浙江省临检中心各项室间质评项目成绩均为合格（优秀）。连续多年获浙江省检验科质量和安全实地考核优秀单位。